Code:
$ cat sample1.txt
Treatment
,parmeter1=value
,parmeter2=value
,parmeter3=value
,parmeter4=value
,parmeter5=value
,parmeter6=value
,parmeter7=value
,parmeter8=value
,parmeter9=value
,parmeter10=value
,parmeter11=value
,parmeter12=value
,parmeter13=value
,parmeter14=value
,parmeter15=value
;;
Treatment
,parmeter1=value
,parmeter2=value
,parmeter3=value
,parmeter4=value
,parmeter5=value
,parmeter6=value
,parmeter7=value
,parmeter8=value
,parmeter9=value
,parmeter10=value
,parmeter11=value
,parmeter12=value
,parmeter13=value
,parmeter14=value
,parmeter15=value
;;
$ sed 's/;;/;;~/g' sample1.txt | tr -d "\n" | tr "~" "\n" | tr -s " "
Treatment ,parmeter1=value ,parmeter2=value ,parmeter3=value ,parmeter4=value ,parmeter5=value ,parmeter6=value ,parmeter7=value ,pa
rmeter8=value ,parmeter9=value ,parmeter10=value ,parmeter11=value ,parmeter12=value ,parmeter13=value ,parmeter14=value ,parmeter15
=value;;
Treatment ,parmeter1=value ,parmeter2=value ,parmeter3=value ,parmeter4=value ,parmeter5=value ,parmeter6=value ,parmeter7=value ,pa
rmeter8=value ,parmeter9=value ,parmeter10=value ,parmeter11=value ,parmeter12=value ,parmeter13=value ,parmeter14=value ,parmeter15
=value;;