Shell Programming and Scripting

b1 ggg b2 fff NA NA hhh NA NA NA NA NA
a1 xxx a2 yyy NA NA zzz NA NA NA NA NA
a1 xxx NA NA a3 ttt NA ggg NA NA NA NA

b1 ggg b2 fff NA NA hhh NA NA NA NA NA
a1 xxx a2 yyy a3 ttt zzz ggg NA NA NA NA

awk '
{a[$1]=$1; f[$1]=NF; for (i=2; i<=NF; i++) if ($i != "NA") b[$1 FS i]=$i} # load id and id columns arrays
END {
   for (i in a) {                                                         # loop thru id array
      l=i;                                                                # initialize output string
      for (j=2; j<=f[i]; j++) {                                           # loop thru id columns array
         l=l FS ((b[i FS j]) ? b[i FS j] : "NA");                         # fill output string with output values from id columns array
      }
      print l;                                                            # print output string
   }
}' infile

awk '
function printP(){ o=P[1]; for (i=2; i<=NF; i++) o=(o FS P[i]); print o }
function updateP(){ for (i=2; i<=NF; i++) if (P[i]=="NA") P[i]=$i }
NR>1 {
  if ($1==P[1]) {
    updateP()
    next
  }
  printP()
}
{ split ($0,P) }
END { printP() }
' infile