COPASI är en programvara för modellering och simulering av biokemiska nätverk. Programpaketet har ett GUI som låter användare definiera biokemiska nätverk modeller genom att ange kemiska reaktioner och kinetiska ekvationer. En kraftfull simulering motorn kan sedan utföra simuleringar av dynamiken i de nätverk och utföra många olika computational analyser. COPASI kan simulera dynamik med hjälp av antingen en ODE eller ett stokastisk kemisk kinetik tillvägagångssätt (Gillespie-typ algoritmer). License: Gratis för icke-kommersiell användning Förändringar:
Avdelningsstatus volymer kan nu fastställas av ODEs eller ursprungliga uppdrag. Ursprungligt uppdrag är nu tillåtna. Det finns nya optimeringsförslag metoder: trunkerade Newton och Praxis. Det finns ett nytt verktyg som kontrollerar kurs lagar för eventuella problem. Import och export av SBML filer har förbättrats. Massan bevarande analys uppgift är nu tillgänglig på kommandoraden version. Det finns en ny kommandorad alternativet att bara validera indatafiler. Det finns många bugfixes.

Mer ...