The UNIX and Linux Forums  

Go Back   UNIX och Linux Forum > Upp Forum > Shell-programmering och Skript
.
google unix.com



Shell-programmering och Skript Post frågor om ksh, CSH, SH, bash, PERL, PHP, sed, awk och andra skalskript och skal skriptspråk här.

Mer UNIX och Linux Forum Ämnen Du kan hitta Helpful
Tråd Thread Starter Forum Svar Senaste Inlägg
Domän inte lösas från script Sergiu-IT IP Nätverk 6 04-11-2008 06:52
Kudda har framgångsrikt löst nedladdning problem för många video web angelstar UNIX och Linux Applications 0 04-10-2008 06:41
XDMCP, dns, överstiger broadcast lösas MEN kymberm IP Nätverk 3 02-25-2003 10:47

 
English Japanese Spanish French German Portuguese Italian Dutch Swedish Russian Norwegian Hungarian Hebrew Danish Bulgarian Greek Powered by Powered by Google
 
LinkBack Thread Tools Sök i denna tråd Rate Thread Visningslägen
  #1 (permalänk)  
Old 11-07-2005
mskcc mskcc is offline
Registered User
  
 

Join Date: Jul 2005
Inlägg: 37
kan detta lösts med awk och sed?

Hej Masters,


Kod:
___________________________________________________________________________________
Group of orthologs #1. Best score 3010 bits
Score difference with first non-orthologous sequence - yeast:3010   human:2754
YHR165C             	100.00%		PRP8_HUMAN          	100.00%
___________________________________________________________________________________
Group of orthologs #2. Best score 2100 bits
Score difference with first non-orthologous sequence - yeast:2033   human:1978
YLR106C             	100.00%		MDN1_HUMAN          	100.00%
___________________________________________________________________________________
Group of orthologs #3. Best score 2082 bits
Score difference with first non-orthologous sequence - yeast:997   human:593
YJL130C             	100.00%		PYR1_HUMAN          	100.00%
___________________________________________________________________________________
Group of orthologs #4. Best score 1959 bits
Score difference with first non-orthologous sequence - yeast:1959   human:1007
YKR054C             	100.00%		DYHC_HUMAN          	100.00%
___________________________________________________________________________________
Group of orthologs #5. Best score 1855 bits
Score difference with first non-orthologous sequence - yeast:1855   human:1022
YNR016C             	100.00%		Q6KE87_HUMAN        	100.00%
YMR207C             	19.86%		COA2_HUMAN          	90.52%
                    	       		COA1_HUMAN          	53.30%
___________________________________________________________________________________
Group of orthologs #6. Best score 1838 bits
Score difference with first non-orthologous sequence - yeast:1748   human:1767
YDL140C             	100.00%		RPB1_HUMAN          	100.00%
___________________________________________________________________________________
Group of orthologs #7. Best score 1768 bits
Score difference with first non-orthologous sequence - yeast:1768   human:1636
YJR066W             	100.00%		Q4LE76_HUMAN        	100.00%
YKL203C             	49.22%

Framför posterna ingår i en fil. Vad jag behöver göra är att extrahera information från filen och lägg dem i en speadsheet format, så här: (exempel från # 5 och # 7 ovan)

Group_number; Best_Score; S_one; P_one; S_two; P_two
5, 1855; YNR016C; 100,00%; Q6KE87_HUMAN; 100,00%
5, 1855; YMR207C, 19,86%, COA2_HUMAN, 90,52%
5, 1855;;; COA1_HUMAN, 53,30%
7, 1768; YJR066W; 100,00%; Q4LE76_HUMAN; 100,00%
7, 1768; YKL203C, 49%;

Tack på förhand!

Senast redigerad av Perderabo; 11-08-2005 vid 11:41.. Anledning: Lägg koden taggar och inaktivera smilies för läsbarhet
 

Komihåglista

Taggar
linux

Thread Tools Sök i denna tråd
Sök i denna tråd:

Avancerad sökning
Visningslägen Betygsätt denna tråd
Betygsätt denna tråd:

Utstationering Regler
Du får inte efter nya trådar
Du får inte efter svar
Du får inte skicka bilagor
Du får inte redigera dina inlägg

BB-kod är
Smilies är
[IMG] kod
HTML-koden är Av
Trackback är
Pingbacks är
Refbacks är




Alla tider är GMT -4. Klockan är nu 11:31.


Powered by: vBulletin, Copyright © 2000 - 2006, Jelsoft Enterprises Limited. Översättningar Powered by .
vBCredits v1.4 Copyright © 2007 - 2008, PixelFX Studios
UNIX och Linux Forum Innehållet upphovsrättsskyddat © 1993-2009. All Rights Reserved.Ad förvaltning RedTyger

Content Relevant webbadresser från vBSEO 3.2.0