COPASI é uma aplicação de software para modelagem e simulação de redes bioquímicas. O pacote de software tem uma interface gráfica que permite aos utilizadores definir modelos bioquímicos rede introduzindo reações químicas e cinética equações. Um poderoso motor de simulação pode, então, realizar simulações da dinâmica das redes e realizar diversas análises computacionais. COPASI pode simular dinâmica usando ODE uma abordagem ou uma abordagem estocástica cinética química (Gillespie-tipo algoritmos). Licença: Gratuito para uso não comercial Changes:
Compartment volumes agora pode ser determinada pelo ODES inicial ou missões. Colocações iniciais agora são permitidos. Existem novos métodos de otimização: Newton truncado e Praxis. Existe uma nova ferramenta que verifica a taxa de leis para eventuais problemas. Importação e exportação de arquivos SBML foi melhorada. A massa conservação análise tarefa está agora disponível na versão de linha de comandos. Há uma nova opção de linha de comando só validar os ficheiros de entrada. Existem muitos bugfixes.

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