COPASI er et program for modellering og simulering av biokjemiske nettverk. Programvarepakken har en GUI som lar brukere angi biokjemiske nettverk modeller ved å angi kjemiske reaksjoner og kinetisk likninger. Et kraftig simulering motoren kan deretter utføre simuleringer av dynamikken i nettverk og utføre mange forskjellige beregningsformelen analyser. COPASI kan simulere dynamikk ved hjelp av enten en ODE tilnærming eller en stokastisk kjemiske kinetics tilnærming (Gillespie typen algoritmer). Lisens: Gratis for ikke-kommersiell bruk Endringer:
Kupé volumer kan nå bestemmes av ODEs eller første oppdrag. Opprinnelig oppdrag er nå tillatt. Det er ny optimalisering metoder: avkortet Newton og Praxis. Det er et nytt verktøy som kontrollerer hastigheten lover for mulige problemer. Import og eksport av SBML filer har blitt forbedret. Massen bevaring analyse oppgave er nå tilgjengelig på kommandolinjen versjon. Det er en ny kommandolinje alternativ til bare å validere input filer. Det er mange bugfixes.

Mer ...