COPASI is een software applicatie voor modellering en simulatie van biochemische netwerken. De software pakket heeft een GUI waarmee gebruikers definiëren biochemische netwerk modellen door chemische reacties en kinetische vergelijkingen. Een krachtige motor simulatie kan vervolgens simulaties van de dynamiek van de netwerken en het uitvoeren van veel verschillende computationele analyses. COPASI kunnen simuleren dynamiek met behulp van een ODE aanpak of een stochastische chemische kinetiek aanpak (Gillespie-type algoritmen). Licentie: Gratis voor niet-commercieel gebruik Wijzigingen:
Compartiment volumes kunnen nu worden bepaald door ODES of in de eerste opdrachten. Eerste opdrachten zijn nu toegestaan. Er zijn nieuwe optimalisatie methoden: Truncated Newton en Praxis. Er is een nieuw instrument dat de controles tarief wetten voor mogelijke problemen. Invoer en uitvoer van SBML bestanden is verbeterd. De massa behoud analyse taak is nu beschikbaar op de command line versie. Er is een nieuwe command line optie om alleen de validering van de input-bestanden. Er zijn vele bugfixes.

Meer ...