COPASI è una applicazione software per la modellazione e la simulazione di reti biochimiche. Il pacchetto software dispone di una GUI che consente agli utenti di definire modelli di rete biochimici inserendo cinetica delle reazioni chimiche e le equazioni. Un potente motore di simulazione può quindi eseguire simulazioni della dinamica delle reti e di effettuare diverse analisi computazionale. COPASI possono simulare le dinamiche utilizzando uno ODE approccio o un approccio stocastico cinetica chimica (Gillespie-tipo algoritmi).Licenza: Gratuito per uso non commercialeModifiche:
Un grave problema nel SBML di esportazione, che portano alla creazione di file non validi SBML duplicato a causa di uso dello stesso SLD, è stato fissato.

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