
COPASI è una applicazione software per la modellazione e la simulazione di reti biochimiche. Il pacchetto software dispone di una GUI che consente agli utenti di definire modelli di rete biochimici inserendo cinetica delle reazioni chimiche e le equazioni. Un potente motore di simulazione può quindi eseguire simulazioni della dinamica delle reti e di effettuare diverse analisi computazionale. COPASI possono simulare le dinamiche utilizzando uno ODE approccio o un approccio stocastico cinetica chimica (Gillespie-tipo algoritmi).
Licenza: Gratuito per uso non commerciale
Modifiche:
Comparto volumi può essere determinata da Odi o assegnazioni iniziali. I primi incarichi sono ora ammessi. Ci sono nuovi metodi di ottimizzazione: troncato Newton e Praxis. Vi è un nuovo strumento che controlli tasso leggi per possibili problemi. Importazione ed esportazione di file SBML è stato migliorato. La massa di conservazione analisi compito è ora disponibile sulla versione a riga di comando. C'è una nuova opzione della linea di comando solo per convalidare il file di input. Ci sono molte correzioni.
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