
COPASI egy szoftver alkalmazás modellezés és szimuláció a biokémiai hálózatok. A szoftvercsomag egy grafikus felület, amelynek segítségével a felhasználók meghatározzák biokémiai hálózat modellek megadásával kémiai reakciók és kinetikai egyenletet. A nagy teljesítményű motor, akkor a szimuláció elvégzésére szimulációk a dinamika a hálózatok végez számos különböző számítógépes elemzése. COPASI lehet szimulálni dinamika használatával vagy az ODE megközelítés vagy a sztochasztikus kémiai kinetika megközelítés (Gillespie-típusú algoritmusok).
Licenc: Ingyenes nem kereskedelmi felhasználás
Változások:
Kompartment kötetek már meg ODEs vagy a kezdeti feladatokat. Eredeti feladatokat jelenleg megengedett. Vannak új optimalizálási módszerek: Truncated Newton és a Praxis. Van egy új eszköz, hogy az ellenőrzések üteme törvények esetleges problémákat. Kivitele és behozatala SBML kép javult. A tömeg megőrzése elemzés feladata most már elérhető a parancssoros változatát. Van egy új parancssori opció csak hitelesíti a bemeneti fájlt. Sok hibajavítás.
Tovább ...