Hello: Van egy másik kérdés. Kérjük, vegye figyelembe a következő két minta, tab tagolt fájlok:

File_1:

Abf1 YKL112w
Abf1 YAL054c
Abf1 YGL234w
ACE2 YKL150w
ACE2 YNL328c
Cup9 YDR441c
Cup9 YDR442w
Cup9 YEL040w
...


File 2:

...
ABF1 YKL112W
ACE2 YLR131C
CUP9 YPL177C
...

File_2 egy "lookup table;" Azt akarom cserélni $ 1 File_1 a megfelelő 2 $ területen File_2, továbbá hozzá egy középső oszlop, amely tartalmazza a string "tf", és egy oszlop az "egyek" ( "1" az első oszlopban pozíció), minden lapon tagolt.

Ezen kívül lenne ideális, ha az ügy lehet figyelmen kívül kell hagyni a keresés / csere, de az ABC-kimenet minden nagybetűs [az] alakítja [AZ].

Tájékoztatásul, ezek a gének élesztő, ezenkívül a számok és betűk, néhány gént tartalmaz kötőjelet (pl. YBR162W-A), de egyik sem tartalmaz majd vessző, pontosvessző, szóköz, stb

Kimenet File_3:

1 YKL112W tf YKL112W
1 YKL112W tf YAL054C
1 YKL112W tf YGL234W
1 YLR131C tf YKL150W
1 YLR131C tf YNL328C
1 YLR131C tf YLR439W
1 YPL177C tf YDR441C
1 YPL177C tf YDR442W
1 YPL177C tf YEL040W
...

Ennek oka, hogy (de eltérő) my korábbi lekérdezés,

Molekuláris biológus igényel segítséget Re: search / Replace script

Itt az első oszlop egy "dummy" súly érték, ahhoz, hogy "mező kompatibilitás," az én korábbi kép, amint a következő példa:

1 a b gi
1 a pp a
1 a pp c
1 t gi u
1 t gi w
1 x gi t
1 t pp z
2 a pp d
2 a pp e
2 t gi v
2 t gi z
3 a b pp
3 t gi y
...

Végül is, én végül egy dokumentációt, mint ez, a $ 1 \u003d tömeg, gene1 \u003d $ 2, $ 3 \u003d szövetség, $ 4 \u003d gene2:


1 YKL112W tf YKL112W
1 YKL112W tf YAL054C
1 YKL112W tf YGL234W
1 YLR131C tf YKL150W
1 YLR131C tf YNL328C
1 YLR131C tf YLR439W
1 YPL177C tf YDR441C
1 YPL177C tf YDR442W
1 YPL177C tf YEL040W
...
1 YBL012C gi YCL045C
1 YBL012C pp YBL012C
5 YBL012C pp YHR039C-A
1 YLR363W-GI YNL143C
A 4 YLR363W-GI YPR123C
1 YLR363W-GI YLR467W
1 YLR363W-A pp YNR073C
2 YBL012C pp YGL232W
2 YBL012C pp YOR102W
A 2 YLR363W-GI YFL066C
A 2 YLR363W-GI YNR073C
3 YBL012C pp YCL045C
A 3 YLR363W-GI YKL100C
...

Thank you - Még egyszer, * nagyon * much appreciated!

Tisztelettel, Greg S. :-)

Ezt kell tennie, hogy a kívánt teljesítmény:

Üdvözlettel

Ez teljesen csodálatos! ... :-)

Itt van a megértése Franklin52 kódja:

Unix Kézikönyvek - AWK Reference

# \u003d\u003d Az "egyenlő"

tolower (string): Visszatérés a string minden nagybetűs karakterek helyett azok kisbetűs helyettesíthető.

toupper (string): Visszatérés a string minden kisbetűs karakterek helyett a nagybetűs helyettesíthető.

FNR: Record szám bemeneti fájlban.

NR: Rekordok száma dolgozni.

Ezért a fent említett script fordítja (? - Kérlek javíts ki, ha tévedek), mint

az awk '
FNR \u003d\u003d NR (a [tolower ($ 1)] \u003d $ 2;) next

miközben a rekord számát (tétel) értéke az összes nyilvántartás (igaz), akkor az összes következő:
get $ 1 ( "a közös gén nevét - konvertálja a kisbetű - szükséges, mivel a megfelelő területet File_1 van kisbetűvel, ellenkező esetben nem fognak" match "- linux kis-és nagybetűk) a lookup file (File_2), set (cseréld ki ) a (már nagybetűs) rendszeres gén neve ($ 2) ugyanabban a feloldó táblára, majd olvassa el a következő rekord számú (sor);

tolower ($ 1) egy (print "1" a [tolower ($ 1)] "TF" toupper ($ 2))

Most minden $ 1 File_2 (most beállítva nagybetű $ 2, a lookup táblázat), a második fájlt (File_1, az egyik meg kell átalakítani), a nyomtatási
"1", 2 $-tól File_2; "tf", 2 $-tól File_1 (vissza a nagybetűs, átalakítani a záró kisbetűs c, w,-a, stb)

' "File_2" "File_1"

File_1 \u003d fájl feldolgozása (átalakított)
File_2 \u003d "lookup file" ( "common_to_systematic.tab)

?


Ez ragyogóan működik!! Köszönöm szépen, Franklin52!?

Volna egy szuper hétvégét! ... Greg :-)

Lehet-e módosítani a fenti szkriptet, nevezni a fájlokat alapuló lookup table?

pl:
Jelenlegi Új
A87324.jpg A1372365.jpg
A89732.jpg A98274.jpg
A130347.jpg A73689.jpg
...

Köszönöm,

Rick

Próbálom, hogy módosítsa a fenti kódot egy hasonló helyzetben. Nekem van két bemeneti fájlt. Az első fájl (adatrögzítők) egy CSV barátságos neveket az első oszlop és UUIDs a második oszlopban. A második fájl (VM) egy lista a fájlok teljes elérési útját használja a UUID. Például:

----- ----- Datastores.csv
rövid név 1, UUID1
rövid név 2, UUID2
rövid név 3, UUID3
stb
----- ----- Datastores.csv

----- ----- VMs.txt
/ folder/UUID3/vm1.vmx
/ folder/UUID2/vm2.vmx
/ folder/UUID1/vm3.vmx
/ folder/UUID3/vm4.vmx
stb
----- ----- VMs.txt

What I am looking for a kimenetre, hogy így néz ki:

----- ----- Output.txt
/ mappa / barát neve 3/vm1.vmx
/ mappa / barát neve 2/vm2.vmx
/ mappa / barát neve 1/vm3.vmx
/ mappa / barát neve 3/vm4.vmx
stb
----- ----- Output.txt

A mintát awk nem intuitív számomra, sőt elolvasása után a másik magyarázatot, és megy át a O'Rielly zseb referencia. Esetében az egyik input, nem kell megváltoztatni - ha probléma van az esetek párja akkor én van más kérdésekkel foglalkozik.

Köszönöm a segítséget előre.

hi guys!!

Én vagyok az új shell szkript .. Szeretném tudni, abt sed parancsot, és hogyan működik?

Itt van, mit akarok csinálni, azt akarom keresni az eredeti karakterlánc export.txt fájlt, amely a következő:
export MIBs \u003d \ opt \ mymibs \

Azt akarom, hogy azt váltsák fel
export MIBs \u003d \ opt \ new_mibs \

Kérem, segítsen vele

thanks in advance