COPASI est une application logicielle pour la modélisation et la simulation de réseaux biochimiques. Le logiciel a une interface graphique qui permet aux utilisateurs de définir des modèles de réseaux biochimiques entrant par les réactions chimiques et les équations cinétiques. Un puissant moteur de simulation peut alors effectuer des simulations de la dynamique des réseaux et de mener de nombreuses analyses différentes de calcul. COPASI peut simuler la dynamique utilisant soit un ODE approche ou une approche de la cinétique chimique stochastique (Gillespie-type algorithmes). Licence: Gratuit pour un usage non-commercial Changes:
Compartiment volumes peut maintenant être déterminée par ODEs initial ou de cessions. Les premières missions sont désormais autorisées. Il existe de nouvelles méthodes d'optimisation: Truncated Newton et Praxis. Il est un nouvel outil qui vérifie le taux de lois pour les problèmes possibles. Importation et exportation de fichiers SBML a été améliorée. L'analyse de la tâche de conservation de masse est maintenant disponible sur la version en ligne de commande. Il existe une nouvelle option de ligne de commande à valider que les fichiers en entrée. Il existe de nombreuses corrections de bugs.

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