COPASI es una aplicación de software para el modelado y simulación de redes bioquímicas. El paquete de software tiene una interfaz gráfica que permite a los usuarios definir bioquímicos red mediante la introducción de modelos de reacciones químicas y ecuaciones cinéticas. Un potente motor de simulación pueden realizar simulaciones de la dinámica de las redes y llevar a cabo diferentes análisis computacional. COPASI puede simular la dinámica ya sea utilizando un enfoque de ODE o un enfoque estocástico cinética química (Gillespie tipo de algoritmos). Licencia: Gratis para uso no comercial Cambios:
Compartimiento de volúmenes pueden ser determinados por ODES o asignaciones iniciales. Asignaciones iniciales se permite ahora. Hay nuevos métodos de optimización: Truncada Newton y Praxis. Hay un nuevo tipo de herramienta que comprueba las leyes de los posibles problemas. Importación y exportación de archivos SBML ha sido mejorado. El análisis de tareas de conservación de la masa ya está disponible en la versión de línea de comandos. Hay una nueva opción de línea de comandos sólo para validar los archivos de entrada. Hay muchos corrección de errores.

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