Hola: Tengo otra pregunta. Por favor, considere las siguientes dos muestras, archivos delimitados por tabuladores:

File_1:

Abf1 YKL112w
Abf1 YAL054c
Abf1 YGL234w
Ace2 YKL150w
Ace2 YNL328c
Cup9 YDR441c
Cup9 YDR442w
Cup9 YEL040w
...


Archivo 2:

...
ABF1 YKL112W
ACE2 YLR131C
CUP9 YPL177C
...

File_2 es una "tabla de búsqueda;" Quiero sustituir $ 1 en concordancia con el File_1 $ 2 en el campo File_2, además de añadir una columna central que contiene la cadena "tf", y una columna de "unos" ( "1" en la primera columna posición), todos delimitado por tabuladores.

Además, sería ideal si el caso puede ser ignorada para la búsqueda / sustitución, pero que la salida se alfabético mayúsculas [az] se convirtió al [AZ].

FYI, estos son los genes de levadura; además de números y letras, algunos de los genes contienen guiones (por ejemplo, YBR162W-A), pero ninguno de ellos contiene comillas, comas, espacios, etc

File_3 de salida:

1 YKL112W tf YKL112W
1 YKL112W tf YAL054C
1 YKL112W tf YGL234W
1 YLR131C tf YKL150W
1 YLR131C tf YNL328C
1 YLR131C tf YLR439W
1 YPL177C tf YDR441C
1 YPL177C tf YDR442W
1 YPL177C tf YEL040W
...

Esto se relaciona con (pero diferente de) mi anterior pregunta,

Biólogo molecular requiere ayuda de nuevo: búsqueda / sustitución script

Aquí, la primera columna es un "maniquí" valor de peso, para mantener "la compatibilidad de campo," con mi anterior expediente, tal como se muestra en este ejemplo:

Gi 1 a b
Págs 1 a un
Págs 1 a c
1 t u gi
1 t gi w
1 t gi x
1 t págs z
2 págs una d
2 bis e pp
2 t gi v
2 t z gi
Págs 3 a b
Gi y 3 t
...

En definitiva, voy a terminar con un archivo de este tipo, con US $ 1 \u003d peso, gene1 \u003d $ 2, $ 3 \u003d asociación, $ 4 \u003d gene2:


1 YKL112W tf YKL112W
1 YKL112W tf YAL054C
1 YKL112W tf YGL234W
1 YLR131C tf YKL150W
1 YLR131C tf YNL328C
1 YLR131C tf YLR439W
1 YPL177C tf YDR441C
1 YPL177C tf YDR442W
1 YPL177C tf YEL040W
...
1 YBL012C gi YCL045C
1 YBL012C págs YBL012C
5 YBL012C págs YHR039C-A
1-A YLR363W gi YNL143C
4-A YLR363W gi YPR123C
1-A YLR363W gi YLR467W
1-A YLR363W págs YNR073C
2 YBL012C págs YGL232W
2 YBL012C págs YOR102W
2-A YLR363W gi YFL066C
2-A YLR363W gi YNR073C
3 YBL012C págs YCL045C
3-A YLR363W gi YKL100C
...

Gracias - Una vez más, * muy * muy apreciada!

Atentamente, Greg S. :-)