hola ... Soy nuevo con cygwin ... y quiero que me ayude. ...
En primer lugar, quiero para determinar el estado de equilibrio en función de un flujo de 2-D usando un conducto mediante el uso de malla cuadrada de la diferencia-finita y metodología para simular quiero .... y lo he leído un montón de información en http://dehesa.freeshell.org/ avout vogle que hacen gráficos y FDLIB ... puede que me digas qué

FDLIB es una biblioteca compartida que enlace contra su propio código. Si no ya escribir sus propios programas, esto va a ser una tarea desalentadora.
1. desarrollar su propio modelo de simulación - parece que hay tutoriales en el sitio que dio - utilizar esos
2. instalar FDLIB - las instrucciones que vienen con
3. compilar el código contra FBLIB, gcc-o myfile.c mi_archivo-libfdlib
- Nota: hice arriba "-libfdlib" el tutorial te dará la forma de vincular contra FDLIB
4. que lo ejecute en vez de datos, la producción de archivos de salida

vogle debe ser el software de gráficos - que por lo general significa que tiene escribir un script para decirle que la forma en que la entrada de datos se define y cómo generar el gráfico. Gráfico de algunos paquetes tienen sus propias "idioma" para programar su uso.

Es lo que vas a necesitar la ayuda de alguien que pueda mirar por encima de su hombro. Hacerlo por control remoto a través de estos foros no es muy eficiente.