
COPASI ist eine Software-Anwendung für die Modellierung und Simulation von biochemischen Netzwerken. Das Software-Paket hat eine grafische Oberfläche, mit der Benutzer festlegen, biochemische Netzwerk-Modelle durch die Eingabe chemischer Reaktionen und kinetische Gleichungen. Eine leistungsfähige Simulations-Engine kann sich dann in Simulationen der Dynamik der Netze und die vielen verschiedenen Computer-Analysen. COPASI Dynamik simulieren können, die entweder eine Ode Ansatz oder eine chemische Kinetik stochastischen Ansatz (Gillespie-Typ-Algorithmen).
Lizenz: Frei für nicht-kommerzielle Nutzung
Änderungen:
Kompartiment-Volumes kann nun nach ODES oder der Aufträge. Erste Aufträge sind nun erlaubt. Es sind neue Methoden der Optimierung: Truncated Newton und Praxis. Es ist ein neues Instrument, dass die Kontrollen Rate Rechtsvorschriften für mögliche Probleme. Import und Export von SBML Dateien wurde verbessert. Die Masse Erhaltung Analyse Aufgabe ist nun auf die Kommandozeilen-Version. Es gibt eine neue Kommandozeilen-Option, um nur die Dateien zu validieren. Es gibt viele Bugfixes.
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