Hallo: Ich habe eine andere Frage. Bitte beachten Sie die folgenden zwei Beispiele, tabulatorgetrennten Dateien:

File_1:

Abf1 YKL112w
Abf1 YAL054c
Abf1 YGL234w
Ace2 YKL150w
Ace2 YNL328c
Cup9 YDR441c
Cup9 YDR442w
Cup9 YEL040w
...


Datei 2:

...
ABF1 YKL112W
Ace2 YLR131C
CUP9 YPL177C
...

File_2 ist ein "Lookup-Tabelle;" Ich möchte, dass an die Stelle $ 1 in File_1 mit dem passenden $ 2 im Bereich File_2, zusätzlich eine mittlere Spalte mit der Zeichenfolge "TF", und eine Spalte mit "Vergehen" ( "1" in der ersten Spalte Position), die alle Tabulatorzeichen.

Außerdem wäre es ideal, wenn der Fall außer Acht gelassen werden für die Suchen / Ersetzen, sondern dass der alphabetischen Ausgabe werden alle Großbuchstaben [AZ] umgewandelt [AZ].

FYI, werden diese Hefe Gene, zusätzlich zu den Zahlen und Buchstaben, einige der Gene enthalten Bindestriche (z. B. YBR162W-A), aber keiner wird ein Komma, Semikolon, Leerzeichen, etc.

Leistung File_3:

1 YKL112W tf YKL112W
1 YKL112W tf YAL054C
1 YKL112W tf YGL234W
1 YLR131C tf YKL150W
1 YLR131C tf YNL328C
1 YLR131C tf YLR439W
1 YPL177C tf YDR441C
1 YPL177C tf YDR442W
1 YPL177C tf YEL040W
...

Dies ist im Zusammenhang mit (aber anders aus) meine frühere Anfrage

Molekularbiologe benötigt Hilfe Re: Suchen / Ersetzen-Skript

Hier wird die erste Spalte ist ein "Dummy"-Gewicht, um die "Vereinbarkeit Bereich," mit meinem früheren Datei, wie in diesem Beispiel:

1 a gi b
1 a pp
S. 1 a c
1 t gi u
1 t gi w
1 t gi x
S. 1 t z
2 a S. d
2 a pp e
2 t gi v
2 t gi z
S. 3 a b
3 t GI y
...

Letztendlich werde ich am Ende mit einer Datei wie dieser, mit $ 1 \u003d Gewicht, $ 2 \u003d gene1, $ 3 \u003d Verein, $ 4 \u003d gene2:


1 YKL112W tf YKL112W
1 YKL112W tf YAL054C
1 YKL112W tf YGL234W
1 YLR131C tf YKL150W
1 YLR131C tf YNL328C
1 YLR131C tf YLR439W
1 YPL177C tf YDR441C
1 YPL177C tf YDR442W
1 YPL177C tf YEL040W
...
1 YBL012C gi YCL045C
1 YBL012C S. YBL012C
5 YBL012C S. YHR039C-A
1-A YLR363W gi YNL143C
4-A YLR363W gi YPR123C
1-A YLR363W gi YLR467W
1-A YLR363W S. YNR073C
2 YBL012C S. YGL232W
2 YBL012C S. YOR102W
2 YLR363W-A GI YFL066C
2 YLR363W-A GI YNR073C
3 YBL012C S. YCL045C
3 YLR363W-A GI YKL100C
...

Vielen Dank, dass Sie - noch einmal, * sehr * sehr geschätzt!

Mit freundlichen Grüßen, Greg S. :-)