COPASI er et softwareprogram til modellering og simulering af biokemiske netværk. Standardprogrammellet har en GUI, som lader brugerne definere biokemiske netværk modeller ved at indtaste kemiske reaktioner og kinetiske ligninger. En kraftfuld simulation motoren kan derefter udføre simuleringer af dynamikken i de netværk og foretage mange forskellige datamodellering analyser. COPASI kan simulere dynamik ved hjælp af enten en ODE tilgang eller en stokastiske kemisk kinetik tilgang (Gillespie-type algoritmer). Licens: Fri for ikke-kommerciel brug Ændringer:
Delmiljø mængder kan nu bestemmes ved ODEs eller indledende opgaver. Oprindelige opgaver er nu tilladt. Der er nye optimeringsforslag metoder: Truncated Newton og Praxis. Der er et nyt værktøj, der kontrollerer sats love for eventuelle problemer. Import og eksport af SBML filer er blevet forbedret. Massen bevarelse analyse opgave er nu tilgængelig på kommandolinjen version. Der er en ny kommando option kun validere inddatafiler. Der er mange fejlrettet.

Mere ...