Hej, jeg er ny i shell-scripts og 1. uge i awk. Jeg har indtil videre formået at formatere output-filer til prøve Fil 1 og Fil 2 som vist nedenfor og Fil 3 output løsning er, hvad jeg leder efter ... tak

Fil 1:
0633-009_001200008: 225065338468009: CMBRTRM: Albuterol
0633-009_001200008: 225065338468009: CMCLAS1: åndedrætsorganerne
0633-009_001200008: 225065338468009: CMCLAS2: lægemidler til obstruktive
0633-009_001200008: 225065338468009: CMCLAS3: adrenergica
0633-009_001200009: 225065338468008: CMBRTRM: Albuterol
0633-009_001200009: 225065338468008: CMCLAS1: åndedrætsorganerne
0633-009_001200009: 225065338468008: CMCLAS2: lægemidler til obstruktive
0633-009_001200009: 225065338468008: CMCLSCD3: R03C
Fil 2:
USUBJID | CMSEQ | CMBRTRM | CMCLAS1 | CMCLAS2 | CMCLAS3 | CMCLSCD1 | CMCLSCD2 | CMCLSCD3 | CMROUTE |
0633-009_001200008 | 225065338468009
0633-009_001200009 | 225065338468008

Need Uddatafilens 3 med Betingelser:
File 1's Field 4 værdier (seprated med ":" for eksempel Albuterol) føjer til fil 2 af
Felt 3 værdi af File 1 (for eksempel CMBRTM) lig File 2 header separeted af | (for eksempel | CMBRTM |) og
for, at rækken af Indsæt fil 2's felt 1 og felt 2-værdier er lig med File 1's område 1 og 2-værdier


Out sætte File 3:
USUBJID | CMSEQ | CMBRTRM | CMCLAS1 | CMCLAS2 | CMCLAS3 | CMCLSCD1 | CMCLSCD2 | CMCLSCD3 | CMROUTE |
633-009_001200008 | 225065338468009 | Albuterol | respiratorysystem | lægemidler til obstruktive | adrenergica |||||
0633-009_001200009 | 225065338468008 | Albuterol | åndedrætsorganerne | lægemidler til obstruktive | | | | R03C | |

så hvad har du med awk?

SÃ¥ langt i min ydmyge arbejde .....

# For File 2, 1st I tried to create unique values from File 1's column 3
# and transpose those values as headers for File 2

awk -F":" '{print $3}' File1.txt | sort | uniq > tst.txt


# for each row of distinct 3rd column values of File 1 , create a file with column headers ( for now hard code first two columns USUBJID and CMSEQ) 


awk -F "/n" '
BEGIN {OFS= "|"}

{
for (i=1;i<=NF;i++)
 {arr[NR,i]=$i;}
}

END {
     printf("USUBJID|CMSEQ|");
     for(i=1;i<=NF;i++)
      {
      for(j=1;j<=NR;j++)
        {printf("%s|",arr[j,i]);}
        printf("\n");
      }
     }' tst.txt > temp1.txt

cp temp1.txt File2.txt




# each 1st and 2nd record in File1.txt file , needs to create a distinct row in File2.txt for 1st and 2nd columns usubjid|cmseq combo

awk -F':' '
   {
        SEQ[$1,"|",$2] = SEQ[$1,"|",$2];
       
   }
   END {

   
          for (i in SEQ)
           
              print i;
          
                           
       }' File1.txt >> File2.txt

Jeg gjort fremskridt, og i denne fase I har brug for hjælp til at finde ud af, hvorfor en ydre for-løkke KSH variabel ikke afkode i AWK men indvendig for-løkke gør. Nedenfor er min kode,
Hvis jeg hårdt kode variabel 'SUBSEQ' i AWK det virker, men hvis jeg forsøger at passere SUBSEQ fra KSH, er det ikke, og når jeg passerer variablen 'Nam' fra KSH virker det: Jeg har hele filen nedenfor. Jeg har brug for hjælp, så koden giver output, hvis jeg afkommentere linjen
# SUBSEQ \u003d " '$ sub'", og udkommentere de papirkopi
SUBSEQ \u003d "0633-009_001200008 | 225065338468009";

Ikke efter, hvorfor hvis blokken ikke vurderer, SUBSEQ if (arr [j, 1] \u003d\u003d SUBSEQ & & & & arr [j, 2] \u003d\u003d NAM)

#! / bin / ksh


# Læse emne og sekvens
sæt-A subseq_array $ (<subseq.txt)


# Læse den gældende QVALS Bestil for undersøgelsen (kan være fra definere)

sæt-A qnam_array $ (<qnam.txt)


for sub i $ (subseq_array [@])
gøre
for n i $ (qnam_array [@])
gøre

# print $ sub;

`awk-F ':' BEGIN ()
(

(
# SUBSEQ \u003d " '$ sub'";
SUBSEQ \u003d "0633-009_001200008 | 225065338468009";
NAM \u003d " '$ n'";
NULL \u003d "|";
)



for (i \u003d 1; i <\u003d NF; i + +)
(
arr. [NR, i] \u003d $ i;
)
)

SLUT (


for (j \u003d 1; j <\u003d NR; j + +)
(

if (arr [j, 1] \u003d\u003d SUBSEQ & & arr [j, 2] \u003d\u003d NAM) (
(printf ( "% s |", arr. [j, 3]);)
exit;)
)



for (j \u003d 1; j <\u003d NR; j + +)
(


if (arr [j, 1] \u003d\u003d SUBSEQ & & arr [j, 2]! \u003d NAM) (
(printf ( "% s", NULL);)
exit;)

)






) 'Supp_q.txt>> out1.txt `

gjort
print $ sub>> out1.txt
break;
gjort



Filerne:
subseq.txt
\u003d\u003d\u003d\u003d\u003d\u003d\u003d\u003d\u003d

0633-009_001200008 | 225065338468009
0633-009_001200008 | 225065338468010
0633-009_001200009 | 225065338468008
0633-009_001200018 | 225065338468009
0633-009_001200018 | 225065338468011

qnam.txt
\u003d\u003d\u003d\u003d\u003d\u003d\u003d

CMBRTRM
CMCLAS1
CMCLAS2
CMCLAS3
CMCLSCD1
CMCLSCD2
CMCLSCD3
CMROUTE

kildefil, at jeg læser fra
supp_q.txt
\u003d\u003d\u003d\u003d\u003d\u003d\u003d\u003d\u003d\u003d

0633-009_001200008 | 225065338468009: CMBRTRM: Albuterol
0633-009_001200008 | 225065338468009: CMCLAS1: åndedrætsorganerne
0633-009_001200008 | 225065338468009: CMCLAS2: lægemidler til obstruktive luftvejssygdomme
0633-009_001200008 | 225065338468009: CMCLAS3: adrenergica til systemisk brug
0633-009_001200008 | 225065338468009: CMCLSCD1: R
0633-009_001200008 | 225065338468009: CMCLSCD2: R03
0633-009_001200008 | 225065338468009: CMCLSCD3: R03C
0633-009_001200008 | 225065338468010: CMCLSCD2: R03
0633-009_001200008 | 225065338468010: CMCLSCD3: R03C
0633-009_001200009 | 225065338468008: CMBRTRM: Albuterol
0633-009_001200009 | 225065338468008: CMCLAS1: åndedrætsorganerne
0633-009_001200009 | 225065338468008: CMCLAS2: lægemidler til obstruktive luftvejssygdomme
0633-009_001200009 | 225065338468008: CMCLSCD3: R03C
0633-009_001200018 | 225065338468009: CMCLAS2: lægemidler til obstruktive luftvejssygdomme
0633-009_001200018 | 225065338468011: CMROUTE: Respir
indledende output-fil, at jeg skriver til fra AWK:
\u003d\u003d\u003d\u003d\u003d\u003d\u003d\u003d\u003d\u003d\u003d\u003d
CMBRTRM | CMCLAS1 | CMCLAS2 | CMCLAS3 | CMCLSCD1 | CMCLSCD2 | CMCLSCD3 | CMROUTE | USUBJID | CMSEQ |

hvad resultatet skal være:
\u003d\u003d\u003d\u003d\u003d\u003d\u003d\u003d\u003d\u003d\u003d\u003d\u003d\u003d\u003d\u003d\u003d\u003d\u003d\u003d\u003d\u003d\u003d\u003d

CMBRTRM | CMCLAS1 | CMCLAS2 | CMCLAS3 | CMCLSCD1 | CMCLSCD2 | CMCLSCD3 | CMROUTE | USUBJID | CMSEQ |
Albuterol | åndedrætsorganerne | lægemidler til obstruktive luftvejssygdomme | adrenergica til systemisk brug | R | R03 | R03C | | 0633-009_001200008 | 225065338468009

awk -F':' -v SUBSEQ="${sub}" -v NAM="${n}" '.....' myFileName
OR
awk -F':' '.....' SUBSEQ="${sub}" NAM="${n}" myFileName